通过体外转录(IVT)获得的mRNA,其反应混合物不仅包含所需的mRNA产物,还包括蛋白质成分(如T7 RNA聚合酶、无机焦磷酸酶)、NTP、模板DNA、盐离子、各类添加剂及IVT中形成的mRNA副产物(如dsRNA和截断RNA片段)等。这些杂质的存在可能对mRNA的功能产生负面影响,例如影响mRNA的定量准确性、降低翻译效率或改变免疫原性。因此,有必要通过纯化技术将目标mRNA从IVT混合物中分离出来,以确保产品的纯度和完整性,从而保障其安全性和有效性。
常见的mRNA纯化方式包括氯化锂(LiCl)沉淀、硫酸铵沉淀、磁珠纯化、硅胶柱膜纯化及层析纯化等。其中,沉淀、磁珠和硅胶柱法操作相对简单快捷,但纯化效率有限,常应用于科研和早期研发阶段。在工业生产中,层析纯化是主要的纯化方法。
硫酸铵沉淀法的探索
2024年1月,中科院过程工程研究所的张松平团队发表了一篇题为“Rapid and high recovery isolation of mRNA from in vitro transcription system by ammonium sulphate precipitation at room temperature”的文章,探讨了硫酸铵沉淀法用于mRNA纯化的可行性。研究显示,在18M的硫酸铵浓度下,mRNA的沉淀率超过95%,并且在该浓度以上,沉淀速率并未显著提高。此外,溶解率也是一个重要指标,影响最终的mRNA回收率。研究表明,当硫酸铵浓度超过18M时,沉淀物能够在3分钟内迅速溶解在不含RNase的水中,溶解率达90%以上。最佳沉淀条件为2M硫酸铵(AS)、pH 7.0、温度20℃,沉淀时间为2小时,可以实现近100%的沉淀率和溶出率。
硫酸铵与LiCl沉淀法的比较
硫酸铵和LiCl沉淀法对NTP的去除率均超过99%,而DNA模板去除率分别约为82%和85%。硫酸铵沉淀法的去除效率低于LiCl沉淀法,但相较于LiCl,硫酸铵沉淀可以在室温下进行,从而更适合放大生产应用。
硅胶柱膜纯化
硅胶柱膜纯化法基于硅胶膜表面硅醇基团与mRNA分子间的相互作用。硅胶膜在高盐环境下,表面带负电的硅醇基团可以通过形成阳离子桥中和mRNA的表面负电荷,促进其结合。在低盐或水溶液中,由于静电排斥,硅胶膜则会释放mRNA。该方法对蛋白质、多糖等杂质不易吸附,使之能够有效分离mRNA和杂质。同时,硅胶柱膜法所用材料安全无毒,符合环保理念,保护实验人员健康,并减少环境污染。这种方法因高效简便,广泛应用于实验室及早期研发阶段。
工业级纯化及其他方法
当前,在工业级别的mRNA纯化中,通常使用层析法来获取更高的核酸质量。Oligo(dT)亲和色谱较为主流,但其无法有效区分带Poly(A)尾的单链RNA和双链RNA等杂质,因此通常与疏水层析、阴离子层析联合使用以提高纯化精度。这些方法适用于mRNA的放大生产,为客户提供全面的解决方案。
利来国际的mRNA纯化服务
利来国际通过自主开发的平台化mRNA纯化工艺,提供工业级mRNA原液定制化生产服务,并针对不同类型的mRNA及需求,提供专业的mRNA纯化工艺开发服务。在为客户进行工艺开发后,成功将mRNA原液的完整度提升了115%,并将总蛋白残留量降至0.02%。我们还开发了适用于科研和早期研发阶段的mRNA纯化试剂盒,具有操作简便、无须大型设备、工艺时间短等优势。
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